In Deutschland und vielen anderen Ländern ist der gezielte Keimbahneingriff gesetzlich verboten. Zum einen gründet das Verbot auf den nicht absehbaren Folgen für mögliche Nachkommen, da beispielsweise unerwünschte Veränderungen im Genom nicht sicher auszuschließen sind und generationenübergreifend weitervererbt werden könnten. Zum anderen hätte die Erforschung eines solchen Verfahrens einen hohen Embryonenverbrauch zur Folge und Humanexperimente mit eventuell unverantwortbaren Abläufen könnten nicht vollständig ausgeschlossen werden. Selbst wenn das Ziel des Keimbahneingriffs grundsätzlich vertretbar ist, wäre also die dafür erforderliche Forschung nach heutigem Stand ethisch nicht zu rechtfertigen. Neben den unkalkulierbaren Sicherheitsrisiken besteht zudem die Sorge, dass die Entwicklung solcher Verfahren den Boden für gezielte, missbräuchliche Modifikationen des menschlichen Erbguts bereiten könnte. Auch eine rechtliche stark begrenzte Zulassung der Keimbahntherapie auf bestimmte, schwerwiegende Krankheiten würde die Gefahr der missbräuchlichen Anwendung voraussichtlich nur unzureichend erfassen, da fraglich ist, nach welchen Kriterien eine Grenze zwischen schweren und weniger schweren Erkrankungen und Behinderungen gezogen werden sollte. Eine breit aufgestellte, kontrovers geführte Diskussion über dieses Thema ist innerhalb der ‚scientific community‘ nie wirklich zum Erliegen gekommen. Man findet sowohl Ansätze, die das Verbot des Keimbahneingriffs bestärken, als auch solche, die die Keimbahntherapie unter bestimmten Voraussetzungen, d. h. falls es eine sichere und zuverlässige Technik dafür gäbe, nicht nur für erlaubt, sondern sogar für geboten halten. 

Für Empörung in der ‚scientific community‘ und der Öffentlichkeit sorgte der chinesische Wissenschaftler He Jiankui, als er im November 2018 die Geburt zweier Babys bekannt gab, die er zuvor genetisch verändert hatte. He Jiankui gab an, mithilfe von CRISPR/Cas9 das CCR5-Gen der Embryonen verändert zu haben, um diese gegen das vom Vater übertragene HI-Virus immun zu machen. Die editierten Embryonen habe Jiankui einer Frau eingesetzt, die daraufhin zwei lebende Mädchen zur Welt brachte. He Jiankuis Vorgehen wurde aus mehreren Gründen scharf verurteilt: Einerseits kann nicht ausgeschlossen werden, dass die Veränderung des CCR5-Gens noch weitere, schwerwiegende Auswirkungen haben könnte, da bisher nicht alle Funktionen dieses Gens vollständig bekannt sind. Andererseits ist die Notwendigkeit dieses Eingriffes stark umstritten, da es bereits sichere Methoden gibt, um die Übertragung des HI-Virus vom Vater auf das Kind zu verhindern. Mit seinem Experiment hat Jiankui zudem eine Reihe von ethischen und wissenschaftlichen Richtlinien wissentlich umgangen. Von der Southern University of Science in Shenzhen, an der er tätig war, wurde er suspendiert. Da auch in China das genetische Editieren menschlicher Embryonen zum Zweck der Reproduktion gesetzlich verboten ist, wurde Jiankui strafrechtlich verfolgt und verurteilt.  

Der Fall sorgte dafür, dass viele Forschende ein globales Moratorium für Keimbahn-Eingriffe forderten, laut dem sich alle Nationen freiwillig dazu verpflichten sollten, auf einen klinischen Einsatz von Keimbahn-Veränderungen an Spermien, Eizellen und Embryonen zu verzichten. Bereits 2017 forderte der Deutsche Ethikrat in einer Ad-hoc-Empfehlung einen internationalen politischen Diskurs sowie internationale Regulierungen zu Keimbahneingriffen beim Menschen. Im Mai 2019 folgte eine ausführliche Stellungnahme des Deutschen Ethikrats, in der sich dieser ebenfalls für ein internationales Moratorium für die klinische Anwendung von Keimbahneingriffen ausspricht, bis die Sicherheit und Wirksamkeit eingesetzter Technologien sichergestellt ist. Zwar ergebe sich aus der ethischen Analyse "keine kategorische Unantastbarkeit der menschlichen Keimbahn", jedoch seien Keimbahneingriffe derzeit wegen ihrer unabsehbaren Risiken als ethisch unverantwortlich zu beurteilen. Gemeinsam mit den Ethikräten Frankreichs (Comité Consultatif National d’Éthique pour les sciences de la vie et de la santé) und Großbritanniens (Nuffield Council on Bioethics) veröffentlichte der Deutsche Ethikrat am 3. März 2020 die "Gemeinsame Erklärung zur Ethik von Eingriffen in die menschliche Keimbahn", in der dazu aufgerufen wird, "bei jeglicher künftigen Diskussion von Keimbahneingriffen und bei der Entwicklung globaler Regulierungsansätze ethische Überlegungen in den Mittelpunkt zu stellen."

Konkret werden darin vier Forderungen gestellt:

1. Genome-Editing soll unter staatliche Kontrolle gestellt und Missbrauch sanktioniert werden.
2. Klinische Versuche sollen nicht ohne eine vorhergehende, breite gesellschaftliche Debatte durchgeführt werden.
3. Es sollen keine weiteren klinischen Versuche durchgeführt werden, solange die potenziellen Risiken nicht signifikant reduziert worden sind.
4. Umfassende Risikobewertung der Auswirkungen klinischer Anwendungen sowohl für Einzelpersonen und Gruppen sowie für die Gesellschaft als Ganzes soll vor deren Zulassung geschehen.