Insbesondere ist der Anwendungsbereich des Vertrags sehr beschränkt, da nur die in Index I des Vertrags aufgeführten 34 Feldfrüchte- und Getreidearten (z.B. Apfel, Banane, Reis, Bohnen) sowie 29 als Futtermittel dienende Pflanzen, und von den genannten gemäß Art. 11.2 des FAO-Vertrags nur die genetischen Ressourcen, die unter der Verwaltung und Kontrolle der Vertragsparteien stehen oder die Allgemeingut sind, unter die Regelungen des Vertrags fallen.